Rédaction : Mathurin Aubry, Julien Birard, Thomas Dagonet
La mise en œuvre de l’action 3 du PNA en faveur du Phragmite aquatique « Approfondir la connaissance et gérer favorablement les habitats du Phragmite aquatique sur les sites de migration pré-nuptiale » se poursuit, pour le moment exclusivement sur le pourtour méditerranéen. Le premier enjeu de cette action est le développement de la connaissance, connaissance sur l’utilisation du territoire par l’espèce et connaissance de la présence des habitats favorables à l’espèce.
Au niveau de la connaissance de sites utilisés en escale migratoire en période pré-nuptiale (mars-avril). Plusieurs méthodes sont développées ou en cours de développement, comme les points d’écoute avec ou non repasse, les enregistreurs passifs ou la capture au filet. En ce qui concerne cette dernière méthode, en 2026, quatre sites ont déployés des stations de baguage avec autorisation du CRBPO pour tenter de capturer des Phragmites aquatiques au moment de leur passage printanier. Ce travail se réalise, dans le cadre du PNA, avec la participation financière des acteurs locaux et du LIFE AWOM. Voici quelques résultats sur ces campagnes de baguage.
Canet-en-Roussillon, dans les Pyrénées-Orientales
Dans la continuité du travail initié au printemps 2025 et des résultats positifs obtenus (6 Phragmites aquatiques bagués), un suivi de la migration prénuptiale de l’espèce a de nouveau été mis en place en avril 2026 grâce à un travail conjoint du Groupe Ornithologique du Roussillon (Mathurin AUBRY) et de la Fédération des chasseurs des Pyrénées-Orientales (Benjamin CALMON) sur la ZPS du complexe lagunaire de Canet – Saint-Nazaire.
Six unités ACROLA (protocole du Muséum-CRBPO) ont de nouveau été déployées dans une des scirpaies du site pendant 15 matinées entre le 8 et le 26 avril 2026, totalisant 91 captures, dont 85 baguages de 17 espèces différentes. 7 Phragmites aquatiques ont été capturés et bagués sur cette période, confortant l’intérêt tout particulier des scirpaies de la lagune de Canet – Saint-Nazaire pour la halte migratoire de l’espèce. Parallèlement, un individu en halte a été observé sur une scirpaie annexe de la ZPS le 17 avril.
Un suivi rendu possible grâce aux financements Natura 2000 obtenus par le gestionnaire de la ZPS, le Syndicat Mixte des Bassins Versants du Réart (SMBVR).
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Canet-en-Roussillon |
Baguage d’un Phragmite aquatique |
Domaine de Canavérier, dans le Guard
Le domaine de Canavérier est un site du Conservatoire du littoral géré par le Syndicat mixte de la Camargue gardoise (SMCG). La diversité des habitats présents et sa localisation en font une halte migratoire particulièrement favorable à de nombreuses espèces d’oiseaux, dont 230 ont déjà été recensées sur le site. Le domaine dispose notamment d’habitats favorables au Phragmite aquatique, en s’appuyant sur les connaissances acquises sur les sites d’escale migratoire de la façade Manche-Atlantique ainsi que sur les études déjà menées en Méditerranée, notamment à Canet-en-Roussillon.
Une opération de suivi par baguage s’est déroulée du 8 au 20 avril 2026, sur dix matinées, avec quatre unités de capture. Cette station, tenue par les bagueurs du SMCG, Thomas Dagonet et Rémi Tiné, avec le renfort d’Eliott Huguet, a permis la capture de trois Phragmites aquatiques (deux individus bagués et un contrôle effectué le lendemain). L’individu contrôlé avait enregistré une prise de masse de 0,7 g en moins de 24 heures ! Au total, 97 individus appartenant à 15 espèces ont été capturés, dont 75 baguages et 22 contrôles. Ces données viennent compléter le suivi de la migration par baguage réalisé à Canet-en-Roussillon, à Pèbre et à la réserve de Biguglia, en Corse.
Le site de Pèbre, en Camargue (13)
Dans le cadre du LIFE AWOM lancé en 2025, la Tour du Valat coordonne un suivi du Phragmite aquatique par baguage et enregistreurs passifs aux printemps 2026 et 2027 sur l’ensemble du pourtour méditerranéen français. Ce suivi répond également à l’objectif de l’action 3 du PNA qui vise à approfondir la connaissance et gérer favorablement les habitats du Phragmite aquatique sur les sites de migration pré-nuptiale.
Le Triangle du Pèbre est un site du Conservatoire du littoral situé dans les Bouches-du-Rhône en Camargue et géré par le Parc Naturel Régional de Camargue, qui abrite des habitats correspondant aux exigences connues de l’espèce : marais temporaire à scirpe, jonchaies inondées, phragmitaies éparses… Proche du trait de côte, il est très bien situé pour accueillir des migrateurs ayant traversé la Méditerranée et le Phragmite aquatique y avait déjà été détecté et capturé en avril 20091. Ce site a donc été retenu pour y installer une station de baguage du 08 au 30 avril 2026. Cinq unités ACROLA (180m de filets) ont pu y être déployées par des bagueurs de la Tour du Valat, Julien Birard, Antoine Arnaud et Thomas Blanchon, durant 17 matinées comptabilisant 130 captures de 23 espèces différentes (121 baguages, 9 contrôles).
Le 10 avril, un Phragmite aquatique a été capturé sur le site, ce qui, additionné aux 8 individus du Canet-en-Roussillon (P-O), aux 2 oiseaux du Canavérier (Gard) et à l’oiseau observé dans le Var par Aurélien Audevard, porte le total de Phragmites aquatiques détectés sur le pourtour méditerranéen français à 12 individus en avril 2026. Mis en perspective avec les 6 individus comptabilisés dans toute l’Espagne sur la même période, ces résultats nous apportent des éléments pour déterminer l’importance du territoire français et en particulier du pourtour méditerranéen pour le Phragmite aquatique en migration pré-nuptiale. Nous espérons que le suivi acoustique déployé dans le même temps sur d’autres sites méditerranéens français viendra gonfler ces résultats. Pour le moment, l’analyse complète des très nombreuses données acoustiques récoltées prendra beaucoup de temps mais un individu chanteur supplémentaire a déjà été détecté dans l’Aude via un enregistreur installé par Sébastien Roques sur la commune de Leucate.
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| Sytème de capture du Phragmite aquatique | au Pèbre © J. Birard |
1Poulin, B., E. Duborper, and G. Lefebvre. 2010. Spring stopover of the globally threatened aquatic warbler Acrocephalus paludicola in Mediterranean France. Ardeola 57: 167–173. https://otop.org.pl/download/Pub_various/Poulin_et_al_2010_Spring_stopover_in_France_ARDEOLA.pdf
Résreve de l’étang Biguglia, Corse
Des tentatives de captures de Phragmite aquatique ont également été réalisées à la réserve naturelle de l’étang de Biguglia par Antoine-Simon Leoncini. En 2026, ce travail n’a pas donné de résultat. Mais des données de passage du Phragmite aquatique en Corse existe. Notamment en 2021, une capture avait été réalisée. 
© J. Jouve